Stiftelsen har som formål å bidra til at områdets verdier blir tatt vare på og har ansvar for å rapportere til Unesco om forvaltning, formidling, forskning og lokalt arbeid med å ta vare på og utvikle verdensarvområdet
For å klare målsettingene for verdensarvarbeidet lokalt og nasjonalt, er Stiftelsen avhengig av godt samarbeid med andre organisasjoner og instanser.
Unescos verdensarvkonvensjon legger stor vekt på at verdensarven skal formidles til barn og unge, slik at de forstår hvorfor hjemstedet deres, natur- eller kulturarven på hjemstedet har fått verdensarvstatus.
Med verdensarvstatusen har Stiftelsen Vegaøyan Verdensarv fått økonomi til å kunne gi tilskudd til fuglevoktere for å være ute på øyene. Dette har gitt en positiv utvikling i Vegaøyene. Antall fugl og fuglevoktere er nå tredoblet fra for noen år tilbake..
Flere forskningsinstitusjoner har gjennom en årrekke drevet forskning på natur- og kultur på Vega; fra steinalder til geologi, marint miljø og dyre- og fugleliv. Den siste forskningsrapporten ble publisert i juli 2023.
